冒険の始まり-マクロ・マーベルはマシーンで小さく(ミクロに)なって体験する「ミクロワールド」というテーマパークを開発しました。ところが、オープニングの日に大変な事件が…。テーマパークを制御するCODE(コード)というコンピューターに異常事態が起こります。チーム・エックスの子供たちとミニ・マーベルはCODEをストップしてマクロ・マーベルを助け出し、世界を救えることができるでしょうか?